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祝贺课题组研究生罗献的文章被生物工程领域顶刊Biotechnology Advances (IF=16.0)接收

魏斌 2023-12-04 5216

       近日,课题组硕士研究生罗献开展的糖丝菌属(Saccharothrix)基因组挖掘工作以“Discovering the secondary metabolic potential of Saccharothrix”为题发表于生物工程领域顶刊Biotechnology Advances。课题组魏斌老师和罗献为共同第一作者,王鸿教授、上海交通大学林厚文教授和李蕾老师为本文共同通讯作者。Biotechnology Advances为中科院一区TOP和浙工大TOP100期刊,最新影响因子为16.0。

       稀有放线菌是活性天然产物最有潜力的来源之一,在这些稀有放线菌中,糖丝菌属(Saccharothrix)因其产生了多种药物先导物而受到了广泛关注。随着微生物基因组数据的积累和生物信息学技术的快速发展,我们对Saccharothrix等稀有菌属的次级代谢潜力的评估可以变得更加全面和准确,但这一领域尚未得到综述或研究。本文首先根据生物合成机制将Saccharothrix菌属已报道的138个次级代谢产物分为五大类,并按类别分析了其化学结构和生物活性的多样性; 随后系统梳理了已鉴定的九种活性天然产物的生物合成途径及催化关键产物合成的生物合成代谢酶; 最后利用化学信息学和生物信息策略分析了Saccharothrix属天然产物家族与其生物合成基因簇家族之间的联系,揭示了Saccharothrix属未被研究的生物合成潜力本文为Saccharothrix等稀有菌属新颖天然产物的定向发现和生物合成提供指导。

全文链接: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0734975023002021?via%3Dihub

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