近日,课题组魏斌老师以“Genome Mining of Chromobacterium Genus Reveals a Class of Nonribosomal Lipopeptides with Potent Antifungal Activity” 为题的文章被中科院一区期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry接收。该研究由浙江工业大学和山东大学卞小莹教授团队联合完成,课题组研究生管玉甜同学为该研究第二作者,魏斌老师为共同通讯作者。该研究的主要创新点如下:1)首次对色杆菌属进行系统性基因组挖掘:对 136 个色杆菌属基因组进行了全面的生物信息学分析,共鉴定出 1713 个 BGCs,并将其划分为 190 个基因簇家族 (GCFs)。该分析首次揭示了该属巨大的、且超过 90% 未被开发的生物合成潜力。2)靶向发现策略的成功:基于上述全局分析,研究人员采用了一种“假设驱动”的靶向挖掘策略,锁定了一个含有起始缩合 (Cs) 结构域和糖基转移酶的、未知的非核糖体肽合成酶 (NRPS) 基因簇家族 (GCF9),并预测其产物为一类新型的糖基化脂肽。3)发现新型抗真菌脂肽:通过对目标菌株 Chromobacterium rhizoryzae 进行基因敲除和代谢物组学分析,成功激活并鉴定了一类全新的糖基化脂肽——chromorhipeptins A-D。4)发现高效生物农药先导物:活性测试表明,chromorhipeptins A 和 B 对多种重要的植物病原真菌表现出极强的抑制活性,其最低抑菌浓度 (MIC) 可达 0.04 µM,显著优于市售农用杀菌剂多菌灵 (carbendazim)。
文章链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jafc.5c04892
