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祝贺课题组博士生周镇燚的文章被Synthetic and Systems Biotechnology接收

魏斌 2025-11-06 578

       基因组挖掘研究不断揭示,微生物天然产物蕴含着巨大的创新潜力。然而,如何从复杂环境样本中高效、低成本地筛选出具有新颖次级代谢潜力的菌株,仍是当前研究面临的关键挑战。针对这一难题,研究团队提出了利用扩增子数据评估微生物次级代谢能力的新策略,并自主开发了分析流程工具 PSMPA(Predicting the Secondary Metabolism Potential using Amplicons)。该工具能够基于 16S rRNA 基因测序数据,快速评估环境微生物群落的潜在代谢能力,为早期筛选具有高研究价值的菌株提供了高效手段。在线平台已公开访问:https://www.psmpa.net。基于上述策略,研究团队成功从海洋环境样本中挖掘并分离出具有潜在新型天然产物合成能力的菌株,进一步鉴定获得了一类新型含硫天然产物,为海洋微生物资源的高效开发提供了创新思路。相关研究成果以“Amplicon-based prediction of secondary metabolic potential of microbiomes facilitates natural product discovery”为题,发表于中科院主管的合成生物学知名期刊《Synthetic and Systems Biotechnology》(中科院一区)。本工作融合了生物信息学、微生物学与天然产物化学等多学科交叉特色,由博士研究生周镇燚为第一作者,王鸿教授和魏斌副研究员共同指导完成。

文章链接:https://doi.org/10.1016/j.synbio.2025.10.012