近日,课题组胡港澳博士生和宋越硕士的研究性论文“Exploring the Diversity and Specificity of Secondary Biosynthetic Potential in Rhodococcus“被国际知名期刊Marine Drugs接收。该研究首先分析了Rhodococcus属菌株编码的生物合成基因簇的多样性和特异性,结果表明87.7%的基因簇家族(GCFs)仅存在于特定的系统发育分支中,这些特异性GCFs主要为NRPS和RiPPs类别。利用抗菌肽深度学习算法分析发现部分RiPPs基因簇编码了十余条潜在的抗菌肽。高通量诱导剂筛选实验(HiTES)结果表明,部分诱导剂能够刺激来自海洋的Rhodococcus菌株产生丰富的新型aurachin类化合物。本研究为针对Rhodococcus属的新天然产物定向挖掘提供了重要见解,特别是种特异性的次级代谢产物。指导老师为魏斌老师和王鸿老师。
文章链接:https://doi.org/10.3390/md22090409
