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祝贺课题组博士研究生应佳亮的文章被Bioresource Technology接收

华熠 2026-04-30 289

      随着微生物基因组测序和天然产物挖掘技术的快速发展,真菌生物合成基因簇(biosynthetic geneclusters, BGCs)所蕴含的巨大次级代谢潜力不断被揭示。然而,大量BGCs仍处于沉默、低表达或产物未知状态,导致其对应次级代谢产物(secondarymetabolites, SMs)难以被系统发现和解析。针对这一问题,课题组以重要真菌属曲霉属为研究对象,构建了整合基因组挖掘、化学信息学分析和实验验证的“基因簇—代谢物”关联研究策略。研究系统分析了1,373株曲霉基因组,利用antiSMASH注释获得66,316个BGCs,并通过BiG-SLiCE将其聚类为基因簇家族(gene clusterfamilies, GCFs);同时,基于Reaxys数据库收集4,724个曲霉来源次级代谢产物,采用结构相似性分析构建分子网络(molecular networks,MNs)。在此基础上,研究进一步结合MIBiG数据库中的已知BGC-SM对应关系,建立了GCF-BGC与MN-SM网络之间的锚定共现评分体系,从而实现曲霉属基因组潜能与化学空间的系统关联。结果表明,曲霉属中超过95%的GCFs尚未与已知代谢产物建立明确联系,其中PKS和NRPS相关基因簇占据重要比例,提示曲霉属仍蕴藏大量有待开发的天然产物资源。进一步地,课题组以海洋来源黑曲霉Aspergillus niger L14为代表菌株,通过OSMAC策略、LaeA全局转录调控因子过表达以及真菌共培养等多种激活方式,验证了其产生非常见的聚酮类和非核糖体肽类次级代谢产物的能力,为生物信息学预测结果提供了实验支撑。相关研究成果以“Establishing linksbetween biosynthetic gene clusters in fungi and their secondary metabolites: Acase study of Aspergillus”为题,发表于国际知名期刊BioresourceTechnology(中科院一区TOP,IF=9.0)。浙江工业大学为第一完成单位,药学院2022级博士研究生应佳亮为论文第一作者,章华伟教授为通讯作者。

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全文链接:https://doi.org/10.1016/j.biortech.2026.134535