近日课题组硕士生董炳城的研究成果“Metabologenomics analysis reveals antibiotic crypticity of Kutzneria viridogrisea DSM 43850” 被应用微生物学会(SfAM)知名期刊Journal of Applied Microbiology正式接收。该研究首先利用二代和三代高通量测序获得了稀有放线菌K. viridogrisea DSM 43850的基因组精细图，通过基因组注释分析确定其编码了9194个功能基因、57个tRNA和12个rRNA。antiSMASH分析结果表明该菌株编码了52个次级代谢产物生物合成基因簇，包括8个新型RiPP类基因簇。其中4个RiPP类基因簇的前体肽为潜在新化合物，另有2个基因簇的编码产物可能分别与erythreapeptin和penisi结构类似。蛋白序列相似性网络分析显示，该菌株共有179个基因与MIBiG数据库中的289个功能基因高度相似，包括43个聚酮合酶、4个酰胺水解酶和2个色氨酸卤化酶等。基于非靶向代谢组学的进一步研究发现，在卡那霉素和依布硒衍生物等特定化学诱导剂刺激下，K. viridogriseaDSM 43850可产生一系列结构可能新颖的次级代谢产物。董炳城的指导老师为魏斌副研究员。

全文链接：https://doi.org/10.1093/jambio/lxaf114